目前部分企业中，尤其是民营企业，普遍在薪酬管理上存在一定的不合理，这些不合理导致薪酬管理最终难以呈现出很好的效果。
第一、薪酬水平低于市场
这也是在薪酬管理不合理中比较普遍的一种现象，在这种情况下，企业的薪酬管理是毫无市场竞争力可言的，当然对于企业吸引和留住人才也是极其不利的。
第二、对公平重视程度不够
公平原则是薪酬管理最重要和最基本的原则，但是由于部分企业对于薪酬管理的公平性重视不够，导致企业的员工流失率偏高，员工工作积极性和满意度低下，严重制约了企业的稳定和发展。
第三、不依据绩效和能力调薪
但凡企业进行调薪，都是需要按照一定依据的，而不是盲目进行，除了要积极参与薪酬调查之外，还需要更多的依靠绩效和能力定薪酬，这也是企业薪酬管理中一个比较关键的环节。
第四、薪酬支付不及时
企业薪酬支付可以说是薪酬管理最后一个环节，但恰恰在这一环节最容易出问题，有些企业故意拖欠或者不及时进行薪酬的支付，这会让员工对企业产生不满情绪，最后不仅不利于员工，也会损害企业的形象。
第五、企业利润不与员工分享
企业的盈利显然离不开员工的贡献，所以企业的盈利自然需要与员工进行分享，只有不怕和员工分钱的企业老板才是好老板，才能让企业的发展更好。
薪酬是企业吸引人才、留住人才很重要的一个条件。薪酬管理要为实现薪酬管理目标服务，薪酬管理目标是基于人力资源战略设立的，而人力资源战略服从于企业发展战略。