武书连2015独立学院评价，继续沿用本科大学的评价体系。区别在于，根据国家对独立学院的定位，考虑到独立学院以培养应用型人才为主，2015独立学院评价人才培养权重所占比例较高，为84.50%;科学研究权重所占比例较低，为15.50%。而同一年度普通高等学校该两项指标的比例是：人才培养56.75%，科学研究43.25%。
与上一年度相比，2015独立学院评价，取消了国家自然科学基金立项数、国家社科基金立项数两项指标，原因是大部分独立学院该两项指标都是以主办学校名义申请的。
排名在200名之后的独立学院只列出分省排名，不列全国排名。
新疆自治区独立学院综合实力排行榜
| 分省排名 | 全国排名 | 校名 | 学校类型 | 学校参考类型 | 备注 | |
| 1 | 新疆医科大学厚博学院 | 医药 | 医学类 | 教学1型 | ||
| 2 | 新疆大学科学技术学院 | 综合 | 文理类 | 教学2型 | ||
| 3 | 新疆财经大学商务学院 | 财经 | 管理类 | 教学2型 | ||
| 4 | 新疆农业大学科学技术学院 | 农业 | 文理类 | 教学2型 | ||
| 5 | 石河子大学科技学院 | 综合 | 综合类 | 教学1型 | ||