北京中医药大学体育教学部工作以《全国普通高等学校体育课程教学指导纲要》和《教育部关于进一步加强高等学校体育的意见》为指导，全面实施《学生体质健康标准》。在上级领导和主管校领导的统一领导下，能够以人为本，牢固树立“健康第一”的指导思想，本着“锐意改革，勇于创新，突出特色”的工作思路，努力推动学校体育教学工作的开展。
体育教学部是学校的直属单位，是在学校主管领导直接领导下的学校体育教学工作的职能部门。目前体育教学部正按照教育部和北中医自身特点的要求，承担全校学生的体育教学、课外活动，校内校外体育竞赛的培养任务。体育教学部现有教职工24人，专任教师 21人，教学秘书1人，教辅2人。其中党员10人，其他党派2人，专任教师中硕士6人，在读硕士3人，8名教师已通过了研究生的课程学习，有高级职称教师5人，讲师8人，助教8人，他们当中有多人是国内武术、足球、健美操等领域里有较大影响的教师。目前体育教学部在职部分教师曾获 “北京市优秀教师”、“北京市青年骨干教师”、“北京市群体先进个人”、“北京中医药大学优秀党员”、“北京中医药大学学生最喜欢的老师”、“北京中医药大学教书育人先进个人”、“全国大学生武术锦标赛优秀教练员”、“北京市高校十佳优秀教练员”、“全国大学生武术锦标赛优秀裁判员”、多名教师在全国高校、全国中医药院校和北京市高校体育科学论文报告会上获“一、二、三等奖”大十余项。