中国农业大学理学院由原应用化学学院、工程基础科学部、信息学院的部分专业于2002年合并而成，下设应用数学、应用物理、应用化学、应用力学四个系。学院拥有农药学国家重点学科、国家理科基础科学研究和教学人才培养基地化学专业点(国家化学理科基地)、农业部农药化学及使用技术重点开放实验室、北京市实验教学示范中心(化学)、农业部农产品质量检验测试中心(北京)。
理学院现有教职工171人，其中专职教师140人，教授30人，副教授65人，具有博士学位的教师约占70%，45岁以下教师约为77%.
近年来，在学校领导大力支持及全院师生的共同努力下，理学院各方面工作取得了显著进展。
教学工作：
理学院为全校开设数学、物理、化学、力学类本科生公共基础课47门，为本院开设专业课116门。2006年总标准学时为62834.5，是我校承担教学工作量最大的学院
在教学工作中，学院特别强调两个并重与两个支撑，即公共课教学与专业课教学并重、教学与科研并重及专业课支撑公共课、科研支撑教学。同时学院强调高水平的教师为本科生上基础课，目前所有教授、博士生导师均开设本科生课程。
近5年学院主持教育部、北京市及学校的各类教改项目26项，发表教改论文百余篇，获国家级教学成果一等奖、二等奖各1项。
科研工作：
近5年主持973课题、 863课题、国家自然科学基金、“十五”攻关、国际合作及横向项目共260项;发表论文800余篇，其中被SCI、EI收录近300篇，2007年发表SCI、EI收录论文的数量名列学校各学院之首。
学科建设经费4510万元;出版专著和教材58部;申请发明专利29项，授权10项;成果鉴定7项;获得农药临时登记证的自主知识产权品种2个，完成新型施药机械产品2个。
获教育部科技进步一等奖1项、其它省部级二等奖2项。小麦化学杂交剂BAU-9403、手性农药环境行为、高效施药机具、系列微乳剂及微胶囊剂等研究达到国际先进水平。
人才培养：
理学院设有农药学博士后流动站;农药学、农产品安全及运筹与管理3个博士点;数学、化学、力学 3个一级学科硕士点;农药学、农产品安全、分析化学、有机化学、固体力学、应用数学、运筹与管理7个二级学科硕士点;化学、应用数学、工程力学三个本科专业。目前在校博士生73人，硕士生148人，本科生918人。
近几年学生创新能力及综合素质明显提高，有多名本科生、硕士生以第一作者发表了SCI收录论文，大多数博士生发表3篇以上SCI收录论文。
在全国大学生化学实验邀请赛、全国大学生数学建模赛、国际数学建模赛中取得了骄人的成绩。考研率、就业率位于学校前列。通过 “大学生村官” 、“红色1+1”等活动，学生的社会责任感明显增强。