环境科学与工程学院成立于2004年，下设环境科学系、环境工程系、环境教育中心、环境科学与工程实验室、环境科学研究所和环境监测中心等教学科研机构。学院的“环境科学”是市重点学科，“环境污染控制与同位素应用技术实验室”是市重点培育实验室，“环境与可持续发展”课程是市重点课程、市精品课程和校级精品课程，以及“珠江三角洲水质安全与保护实验室”是教育部与广东省共建实验室。实验室建筑面积达3000多平方米，仪器设备先进，总值达1500多万。
现有教职工45人，其中专任教师31人，其中教授7人，副教授13人，硕士生导师11人，有博士学位的有22人，享受国务院政府特殊津贴专家2人，教育部新世纪优秀人才1人，广州市优秀专家3人，另外聘客座教授19人。学院现有环境科学和课程与教学论（环境教育方向）硕士学位点，以及环境工程工程硕士学位点，拥有环境科学和环境工程2个本科专业，普通全日制本科生473人，硕士研究生31人。拥有环境辐射污染与防治、食用蓝藻生理生态学、环境中挥发性有机污染物的分析与控制技术和铅同位素环境地球化学等4个高水平科研创新团队。形成了稳定和鲜明特色的环境地学、环境化学、清洁生产与资源综合、环境生态学和水污染控制等5个研究方向。五年来主持国家自然科学基金重点项目等科研项目60余项，合计金额1800多万元；在国内外有重要影响的学术刊物上发表论文近300篇，被SCI、EI、ISTP收录的40余篇；出版专著、教材近10部；获得专利近10项。