土木工程学院是由原哈尔滨建筑大学的建筑工程学院和原哈尔滨工业大学的建筑工程与设计学院的建筑工程系合并而成，创建于1920年，是国内少数几所最早培养土木工程学科专门人才的单位之一。学院设有土木工程、理论与应用力学二个本科专业，结构工程、工程力学、防灾减灾工程与防护工程和固体力学五个硕士点学科，结构工程、工程力学、防灾减灾工程与防护工程和岩土工程四个博士点学科;土木工程和力学二个一级学科博士后流动站;结构工程学科设有长江学者奖励计划特聘教授岗位。学院拥有1个部级重点实验室，4个部级重点学科，其中土木工程专业于1995年以优异成绩首批通过了国家专业认证评估，并于2000 年6月国家专业复评中再次获得优秀评价，2001年结构工程学科被评为国家重点学科。
学院现有是一支基础雄厚、搭配合理、学术思想活跃、整体素质高的教师队伍。其中中国工程院院士3名，博士生导师16人，教授24人，副教授33 人。其中有博士学位的教师30人，担任全国学会理事及以上职务的有10余人。参加国家规范编制的有近20人，在国内外学术刊物中担任编委的有10余人，目前，本院在校学生共1723人，其中硕士生125人，博士生66人，在站博士后16人。学院为国家培养了一大批优秀的高质量毕业生。
八十年来，土木工程学院在教学、科研、人才培养、学术交流等方面积极进取、不懈努力，取得了突出成绩。目前，本院正在承担并联合主持国家自然科学基金九?五重大项目一项，国家自然科学基金12项，其它项目34项。在大跨空间结构、高层钢结构与轻钢结构、钢管砼结构、预应力砼结构、配筋砌体结构、地震工程、结构振动控制、工程结构诊治技术，地基与基础工程，岩土工程灾害与防治，结构与工程系统优化，结构可靠度分析与设计等方面取得了高水平成果。