哈尔滨工业大学计算机专业创建于1956年，是中国最早的计算机专业之一。
在1985年，它又发展成计算机科学与工程系，并建立了计算机科学技术研究所。2000年，计算机科学与技术学院成立。
目前，哈工大计算机科学与技术学院拥有一个博士后流动站，计算机科学与技术一级学科博士学位授予权;有4个博士学位授予权;有4个博士点和4个硕士点，其中包括计算机学科的3个博士点(建于1986年的计算机应用技术博士点为国家重点学科;建于1981年的计算机系统结构博士点是我国首批博士点;计算机软件与理论博士点建于1998年。)以及模式识别与智能系统博士点。学院由计算机科学与工程系(包括8个教研室)。计算机科学技术计算机科学技术研究所，计算机信息网络中心，计算机信息内容安全国家重点实验室，计算机接口技术与接口系统国家实验室，计算机接口系统国家重点专业实验室，可穿戴计算工程中心，计算机系统安全技术研究中心，计算机系统与安全技术研究中心，计算机集成制造与信息技术研究中心，语言技术研究中心，生物信息中心，机器人足球技术研究中心，IBM技术中心，计算机新技术研发中心等单位组成。
目前，学院拥有教职工272人，其中，博士生导师24人，教授34人(45岁以下的15人)，副教授及副高职90余人。学生2196人，博士生 209人，硕士生487人，本专科生1500人。有在站博士后6人。学院现有教学科研实验用房面积约为9000多平方米，有各类计算机1600多台套。
46年来，哈尔滨工业大学计算机学院培养出了数以千计的计算机专业人才，桃李满天下;其自身发展也十分迅速，在教学科研上取得了丰成果。近年来学院承担了国家各部委的一些大型的高水平科研和工程项目，如航天容错错计算机、并行阵列计算机、多功能感知机、星载自主控制计算机、三峡工程总经理综合查询系统、掌上型输入电脑等等;并形成了自己有特色、有优势的研究方向，如并行计算技术、容错计算技术，智能计算机接口技术、机器学习与专家系统、自然语言理解与中文信息处理、模式识别人工智能、智能机器人技术、分布式操作系统、分布式信息处理等等。
学院的国际学术交流也很广泛，已与美、欧、亚洲10多个国家和地区的30多所高校及公司进行了交流，并建立了密切合作关系，影响不断扩大，在国内外具有较高知名度。
哈工大计算机科学技术学院被列入我国211工程和若干所重点建设一流大学重点建设学科，形成了计算机应用技术重点学科带动整个一级学科的良好发展局面。学院以规格严格、功夫到家、求实创新、探索进取为院训，正在努力实现着办一流学科、出一流基地、育一流人才的发展战略目标。