哈尔滨工程大学是首批入选国家“211工程”建设和设有研究生院的全国重点大学，是我国“三海一核”(船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用)领域重要的人才培养和科学研究基地。哈尔滨工程大学具有光荣的历史传统，前身是创建于1953年的中国人民解放军军事工程学院(“哈军工”)。1970年，在哈军工原址，以海军工程系全建制及其它各系(部)部分干部教师为基础，组建哈尔滨船舶工程学院，1994年更名为哈尔滨工程大学。1978年，学校被国务院确定为全国重点大学;1982年成为首批具有博士、硕士学位授予权的单位;1996年进入首批“211工程”建设高校行列;2002年由教育部批准设立研究生院;2007年，由国防科工委、教育部、黑龙江省政府、海军四方共建。学校现隶属于工业和信息化部。
哈尔滨工程大学软件学院是2008年8月获得黑龙江省教育厅正式批复组建，11月正式成立的哈尔滨工程大学的直属二级学院。2011年学院软件工程专业获批国家一级学科博士点和黑龙江省重点专业建设。学院按照省教育厅的要求，为适应国家和黑龙江省发展软件产业对人才的迫切需求，该院依托本校计算机科学与技术学科及相关专业的综合办学优势，按照“办学层次化、运作企业化、管理专业化”的办学模式，产学研紧密结合，学院在夯实学生的基础的同时，十分重视学生实践能力的培养。一方面与国内外知名企业开展多种形式的定制培养，建立实习、实训基地，为学生提供更多的实践、锻炼的机会;另一方面充分借助与日、韩、欧美的良好合作基础，坚持开放式办学，不断地、全方位地开展国际学术交流与合作，已与国内外多所知名高校和企业开展合作关系。理论与实践并重，大力提高办学水平，使哈尔滨工程大学软件学院成为我省培养计算机软件领域高层次、复合型人才的重要基地。哈尔滨工程大学软件紧密跟踪人才的实际需求，结合产业实践和国际IT领域前沿动态制定教学大纲和课程体系，实施与市场接轨的教学计划，强化外语训练，开设企业文化、沟通技巧、素质修炼等方面的课程，提高学生的管理、沟通和团队协作的能力;开设前沿技术课程，真正做到与产业实践结合，与国际发展接轨。培养适合产业发展需求的基础扎实、素质全面、具有国际视野和创新能力的高素质人才。
哈尔滨工程大学软件学院拥有一支高学历、高职称、教学科研经验丰富的师资队伍和现代化的教学设备。许多骨干教师曾被派往美国、英国、加拿大、俄罗斯、澳大利亚以及日本等国进修学习，部分教师在国内的学术组织中任职，享有较高的声誉。学院还聘请外籍教师和国内外具有资深研发经验的高级研发人员讲座、授课，带领学生共同完成部分专业课和实践课教学任务。