1952年全国高校院系调整时,国家从北京大学等部分重点高校选派一批数学家组建和创办了原吉林大学数学系。1978年经原国家教委批准建立数学研究所。2001年由原吉林大学、吉林工业大学、长春科技大学、白求恩医科大学、长春邮电学院的数学系、教研室合并组建成吉林大学数学学院。经过几代数学家的努力,吉林大学数学学科已经成为在国内外具有重要影响的数学科研与教学基地，目前，吉林大学数学学科又进入蓬勃发展的新阶段。
数学学院现设有基础数学系、应用数学系、计算数学系、概率统计系、工程数学系、运筹与控制、金融数学等7个系及1个公共数学与教学研究中心，有数学与应用数学、信息与计算科学、理论与应用力学、统计学4 个本科专业。数学研究所设有14个研究室，有基础数学、应用数学、计算数学、运筹学与控制论、概率论与数理统计、流体力学、课程与教学论等7个硕士点。1988年被批准成立数学博士后科研流动站，1991年被确定为首批国家“理科基础科学研究和教学人才培养基地”，后经教育部与基金委专家评估，被评为“国家优秀人才培养基地”并于 2002年正式挂牌。1993年与计算机学院共同建立了“符号计算与知识工程”教育部重点实验室，1998年被国家批准为数学一级学科博士学位授权点，并得到国家“211”重点学科建设项目支持，有“985工程”计算与软件科学科技创新平台1个 。2007年数学学科被确定为一级学科国家重点学科，计算数学学科和应用数学学科被认定为二级学科国家重点学科。同年数学与应用数学、信息与计算科学专业被批准成为吉林省高等学校特色专业建设点，数学与应用数学被批准成为国家第一类特色专业。院、所积极建设新的交叉学科，在统计学专业开设了保险精算专业方向并于2006年开始招收本科生，2008年开始与吉林大学经济学院联合招收保险精算专业硕士研究生,2009年与吉林大学经济学院共同建立吉林大学金融学院与金融研究院。
院、所现有本科生1181人，硕士生361人，博士生130人，教师、科研人员150名，其中国家教学名师1人，“长江学者”特聘讲座教授1人，国家级百千万工程国家级人选1人，教育部骨干教师5人，教育部跨世纪人才及新世纪优秀人才8人，宝钢优秀教师奖5人，吉林省教学名师4人。教授49名，博士生导师47名(含兼职)、副教授40名。中科院院士王湘浩教授、著名数学家江泽坚教授、徐利治教授、谢邦杰教授、王柔怀教授等曾在原吉林大学数学系任教。
院、所的科研、教学成绩显著。近年来获国家自然科学奖2项、国家科技进步奖1项、教育部自然科学一等奖1项、教育部自然科学二等奖1项、原国家教委和教育部科技进步奖14项、其他省部级科技奖6项;获得国家杰出青年基金3项，香港“求是”科技基金会“杰出青年学者奖”1项、国家教育部跨世纪人才及新世纪人才基金8项。承担国家863项目1项，973项目5项，国家基金委重点重大项目4项。获得国家级优秀教学成果特等奖1项，国家级精品课程4项，省级优秀教学成果奖11项，省级精品课程6项，宝钢教育奖4项，霍英东基金青年教师科研基金和青年教师教学奖3项。获得国家级优秀教材奖1项，原国家教委优秀教材奖2项，省部级优秀教材奖26 项。承担了教育部基地创名牌课程项目5项，国家十五规划教材建设项目8项，国家“十一五”规划教材项目11项，面向21世纪教材5项，国家新世纪网络课程项目1项等。 2008年,以李勇教授为带头人的《国家数学人才培养基地教学团队》被确定为国家级教学团队。
院、所与国内外多所知名大学建立了交流合作关系。每年都邀请国内外学者来校讲学或进行短期访问，同时也选派教师到国内外科研机构和大学访问或进修。毕业生和教师中已有200多人在国外攻读博士学位或工作，其中许多人已经获得博士学位，大部分已归国工作。
院、所拥有国内一流的数学图书资料室和多个设备先进的实验室。其中包括面向本科生开放的数学基地实验室、力学实验室、公共数学教学中心实验室，拥有国内一流的数学图书资料室。实验室已经全部联成局域网并通过校园网联接到因特网，从而与世界各地建立了广泛的网络联系。
学院设有多项奖助学金。除学校统一发放的优秀学生奖学金外，设有数学“基地”奖学金和企业赞助的奖学金。另外学院设立了“爱心基金”，以资助家庭困难的本科学生。
始终重视保持和提高教学水平与人才培养质量，是吉林大学数学学科的优良传统。近年来，我院每年均有超过50%的本科毕业生被国内各重点院校录取为硕士研究生，特别是“基地班”的学生有三分之二以上的学生被免试推荐攻读硕士学位。在大学生数学建模竞赛中，我院学生有数十人获得国际数学建模竞赛和全国数学建模竞赛一、二 等奖。
50多年来，数学学院、数学研究所为国家科研单位、高等院校、政府相关、大型企业、部队和高科技公司等输送了以中国科学院董蕴美院士和被评为2007年中国软件行业十大领军人物的程传海为代表的近万名高级人才。
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