物科学学院的前身是原中国人民解放军军需大学农副业生产系， 2004年8月原军需大学移交教育部管理，与吉林大学合并后整合优势学科组建而成。
学院涵盖理学、农学和工学三大学科门类，具有生物学、作物学、植物保护学、农业资源利用学、园艺学5个一级学科，开设农学、植物保护、园艺、农业资源与环境、生物技术（植物）5个本科专业。
参与生物学博士后流动站和生物化学与分子生物学博士点的招生与建设，拥有植物学二级学科博士学位授权点，作物学、植物保护学、农业资源利用学3个一级学科硕士学位授权点，植物营养学、植物学2个二级学科硕士学位授权点，以及作物、植物保护和农业资源利用、园艺学3个农业推广硕士学科点。其中作物遗传育种学、植物病理学为省级重点学科。 2007年，植物保护专业被确立为国家 “ 第二类特色专业建设点 ” 。
学院拥有一支结构合理、素质良好、富有敬业精神的教职工队伍，我院师资主要来自国内一流重点大学和研究机构，如中国科学院、中国农业科学院、浙江大学、哈尔滨工业大学、东北大学、中国农业大学、南京农业大学等。学院现有专职教师49人，返聘教师1人，实验教师15人；其中教授10人，副教授14人，讲师27人；高级职称人员占教师总数的48.9% ，具有博士学位的教师占教师总数的71.4%；有博士研究生导师8人，硕士研究生导师34人；此外，又从中国农业科学院、香港中文大学、中国农业大学、南京农业大学、东北农业大学等科研院所聘任院士、长江学者奖励特聘教授等7名专家为学院客座教授。学院现有在校本科生918人，研究生132人，在三届毕业生中，40余人被推荐为北京理工大学、东北师范大学、南京农业大学、华南农业大学、吉林大学等知名院校免试研究生，占毕业生总数的16%；6名硕士研究生被国家留学基金委选派到德国、日本攻读博士学位。
学院科研育人特色突出，设有植物生物技术实验室、植物生理生化实验室、生物学实验室、植物遗传育种实验室、植物栽培与利用实验室、植物保护实验室、生态与气候实验室、农业化学和资源实验室、农药实验室、CAD（计算机辅助设计）工作站、数码互动显微镜实验室、机械工程综合实验室共12个本科教学实验室。为培养本科生科技创新能力，学院组建了植物基因工程研究中心、植物分子生物学研究室、生物种质资源与利用研究室、有害生物综合防治研究室和农业生态与环境研究室等综合研究平台；正在建设以美国加州大学 林辰涛 教授为首席科学家的土壤 ―― 植物分子遗传学实验室。学院重视学生实践能力培养，建有占地70万平米的农业教学科研实习基地，其中示范用地53万平米，实验用地7万平米，日光温室3000平米，智能温室2000平米，果园1.5万平米。与10多家企事业单位合作建立了校外实习基地。
学院主持参加了国家“九•五”重中之重科技攻关、“ 十一•五 ”国家支撑、“973”、“863”项目、国家自然科学基金、行业发展计划、留学归国科研基金、省科技厅等项目科研课题，目前学院在研项目68项，到位经费1000 余万元。先后获得省部级科研成果19项，其中省级科技进步二等奖以上12项，三等奖6项。军队教学成果二等奖2项；主持国家多媒体教材、国家级电视教材、国家级网络课程、吉林省精品课程各1门。建院几年来公开发表论文520多篇，其中被SCI、EI收录140余篇。学院积极开展国内、外交流与合作，在国内与十几所高校与科研院所建立了科研合作关系，吸引了大批客座人员和访问学者来院工作；在国外，先后与美国、加拿大、日本、澳大利亚、英国、德国、瑞典、菲律宾等10多个国家开展学术交流与合作，提供师生出国进修学习、攻读学位、学术考察和合作研究等。
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