东北师范大学自然博物馆暨吉林省自然博物馆始建于1987年7月20日，原隶属于吉林省文化厅，为吉林省唯一省级自然博物馆。2001年1月1日，吉林省政府为让自然博物馆获得更好发展并发挥更大功能，决定将吉林省自然博物馆整建制地划给东北师范大学，并且每年仍由省财政对自然博物馆进行全额拨款，而且决定为建设新馆投资4000万元，另由东北师范大学投资5300万元，总投资达9000多万元人民币建设自然博物馆新馆。新馆建设是吉林省“十五”计划重点项目之一，场馆占地面积4公顷，建筑面积14700平方米，展厅面积6000平方米，库房面积3000平方米。建筑工程于2006年9月10日竣工，展览于2007年5月1日布置完毕，并随即向社会开放。
目前展览共分《林之韵》、《山之魂》、《蝴蝶谷》、《鸟之灵》、《兽之趣》和《化石世界》六个展区进行展示，其中《林之韵》、《山之魂》为主要展区，它突出吉林省地方特色，主要展示吉林省具有代表性的生态景观——长白山，其他展区配合介绍了与吉林省生态环境有关的地质古生物、动物、植物等相关知识。陈列展览中还设计了一些有益于中小学生身心健康的项目，如鼓励增强勇气的攀岩，克服恐高心理障碍的高架玻璃桥，满足探秘心理的林中通幽，提高动手能力的标本制作、扩展知识面的联网计算机知识问答等，让观众在参观中得到身心的快乐，知识的熏陶，审美的情趣。
展览的开放将丰富人们的精神文化生活，对普及科学知识、提高公民科学文化素养具有积极的促进作用。展览的目标是达到全国一流展览的水平，成为全国博物馆陈列展览的精品。其影响力将覆盖全省.波及全国。
东北师范大学自然博物馆作为吉林省唯一一所从事自然科学普及教育工作的省级博物馆，拥有一支强大的专门从事自然科学知识的科学研究、科普宣传、展览设计、制作、展示的专业队伍，并配有专业的讲解人员和管理人员。而且，自然博物馆自1987年建立以来，就在积极发挥着“自然标本收藏、自然科学研究、科学普及教育”三大自然博物馆功能，收藏自然展品3万多号,5万1千多件，包括动物、植物、古生物化石、人体、矿物、岩石、陨石等，其中东北地区绝灭动物化石标本4000多件，大型珍稀动物标本7000多件;出版科普著作和科普资料30余部;举办的大型科普展览10余个,临时科普展览几十个。
鉴于东北师范大学自然博物馆在科学普及工作领域做出的巨大贡献，1999年被中国科学技术协会认定为“全国科普教育基地”;2000年被长春市教育委员会指定为“长春市中小学生科技活动基地”;2007年被吉林省科学技术厅指定为“吉林省科普基地”;2007年被共青团吉林省委、吉林省教育厅、吉林省少先队工作委员会、吉林省新闻工作者协会、吉林省教育学会、吉林省学生联合会等共同认定为“吉林省青少年新闻小记者培训基地”。
今后，东北师范大学暨吉林省自然博物馆将以办成全国一流的博物馆为目标，以一流的设施，一流的陈列，一流的服务迎接海内外广大观众。