一、培养目标
二、研究方向
1、化学工程与管理 2、分析技术与质量管理 3、材料化学与工程 4、制药技术与管理 5、精细化工技术
三、培养方式和学习年限
采取“进校不离岗”的在职学习方式，利用双休日和集中学习相结合方法学习。并由学院与研究生所在单位各委派指导教师负责培养和指导。论文的选题应直接来源于生产实际或具有明显的生产背景与应用价值。 学习年限从入学到获得学位一般为2年半左右。
四、学位论文
学生在规定年限之内修满规定学分，成绩合格，完成学位论文(论文形式可以是工程项目技术报告、关键技术的研究论文、工程项目管理成就等)并通过南京大学组织的答辩，经校学位委员会审核批准后，授予化学工程硕士学位证书。
攻读工程硕士学位的研究生，应获专业课程学分不少于24，共计32学分。
五、课程设置
公共课：政治 2学分;英语 3学分
公共专业基础(以下每门3学分，任选6门 18学分)
高等无机化学 现代有机合成 高等分析化学 化学信息与检索
计算机化学 现代化工技术 管理学导论
专业课(以下专业方向课每门3学分，任选2门 6学分)
化学工程与管理、分离技术、工业催化、洁净生产与绿色化学、材料化学、化工过程计算机模拟、现代分析技术与质量管理、色谱技术、光谱技术、在线分析与质量控制、电化学分析基础、材料化学与工程、功能材料、纳米材料与结构、高分子材料加工与应用、高分子材料化学与物理、制药技术与管理、天然产物化学、药物制剂新技术、药物分析、组合化学、精细化工技术、分离技术、手性合成、精细化工过程与设备
必修环节
1、文献综述与选题报告 1学分(考查)
要求在查阅一定数量文献资料的基础上，写出不少于6千字的书面报告，内容包括文献综述与选题报告两部分。考核成绩含书面报告和口头报告成绩两部分。
2、中期汇报 1学分(考查)
选题报告通过后，在论文工作的中间阶段，就所研究课题在一定范围内作学术汇报一次。