山东科技大学研究生教育始于1979年，是国务院学位委员会批准的首批具有硕士学位授予权的单位;1995年被国务院学位委员会批准为博士学位授予单位;2003年经国家劳动人事部批准设立博士后科研流动站。1991年被原国家教委批准具有单独组织硕士生招生入学考试权的单考单位;1997年被国务院学位委员会批准有权开展以研究生毕业同等学力申请硕士学位工作单位;2001年被国务院学位办批准为工程硕士授权单位。目前，已拥9个博士后科研流动站，8个博士学位授权一级学科，43个博士学位授权二级学科;27个硕士学位授权一级学科，127个硕士学位授权二级学科;6个专业学位类别，其中工程硕士有19个授权领域。学位授权点学科覆盖面已拓展至理学、工学、管理学、文学、法学五大学科门类的30个一级学科。截至2013年底，已累计培养各类研究生15000余名;目前在校博士、硕士研究生6000余名。
研究生学院是学校学位与研究生教育工作的职能部门，负责各类研究生的招生、培养、管理、学位授予、就业指导工作和学校学位评定委员会交办的有关事宜。学院下设招生办、学位办、培养管理等科室。近些年来，学校抓住高等教育大发展的机遇，坚持 “立足基础，突出特色、强化内涵、着眼创新”的学科建设之路，大力发展研究生教育，研究生规模和学科、专业数量快速增长，培养质量和学位授予质量不断提高。为适应学校研究生教育快速发展的要求，不断提高研究生培养质量，研究生学院在科学化、规范化管理方面做了卓有成效的工作。1997年，被授予“全国普通高校招生和研究生招生工作先进集体”，1998年被授予“全国煤炭院校招生工作先进集体”、“全省普通高校招生和研究生招生工作先进集体”，1999年被山东省教委授予“全省学位与研究生教育工作先进集体”，1997年《发展研究生教育促进办学水平的提高》项目获山东省优秀教学成果一等奖。1997年研究生招生计算机管理软件，在全国研究生招生优秀计算机辅助管理软件评选中获原国家教委三等奖，2002年山东省教育厅授予“全省高等学校招生工作先进集体”，2005年山东省教育厅授予“全省高等教育学历证书电子注册管理工作先进集体”。1名工程硕士获全国“做出突出贡献的工程硕士学位获得者”称号。
2010年学校被教育部确定为首批全国专业学位研究生教育综合改革试点单位，矿业工程、测绘工程为试点领域，成为全国64所试点单位之一;同时我校荣获教育部“全国工程硕士研究生教育创新院校”殊荣，矿业工程、测绘工程2个领域为“特色工程领域”;近年来，我校获得全国优秀博士学位论文提名论文2篇，山东省优秀博士学位论文19篇，山东省优秀硕士学位论文48篇。