医学部是苏州大学于2008年初由医学院各系与生命科学学院、放射医学与公共卫生学院和药学院组建而成。医学部为学校医学和生命科学教育管理的实体单位，统一负责并管理医学和生命科学类的学生培养、就业指导、科学研究、学科专业建设、人才队伍建设、社会服务以及日常工作。医学部内设：党务行政管理工作办公室（简称：医学部办公室）、教学办公室（含本科生、留学生、成教生）、学生工作办公室（含本科生、研究生、留学生、成教生）、科研办公室、研究生办公室和发展办公室。医学部下设：基础医学与生物科学学院、放射医学与公共卫生学院、药学院、护理学院、第一临床医学院、第二临床医学院、儿科临床医学院，学部内设教学实验中心和动物实验中心，拥有附属医院10所，教学医学院61所。预防医学和法医学和药学实习基地各10个，生物与农学实习基地22个。
医学部拥有基础医学一级学科博士点和临床医学一级学科专业学位博士点，2个博士后流动站，共有博士学位点37个，硕士学位点71个。医学部设有医学、药学和生命科学类本科专业及专业方向20多个，其中临床医学为江苏省品牌专业，放射医学和生物技术专业为江苏省特色专业。临床医学七年制专业为本硕连读，放射医学为国家管理的专业点，也是江苏省人民政府与国防科学技术工业委员会重点共建的专业。目前在校本科生4442人，博士、硕士研究生2200人，东南亚留学生674人。在校成教生2688人，在职成教生4028人。
医学部现有国家级重点学科3个：内科学（血液病）、放射医学、外科学（骨外科）；国防科工委重点学科2个：放射医学、内科学（血液病）；省135重点医学学科6个。学部设有江苏省血液研究所、苏港合作苏州中药研究所、核事故医学应急中心、蚕桑研究所、水产研究所、新药研发中心等科研机构17个。近三年来，医学部获得国家科技成果二等奖1项，承担省部级以上各类项目108项，获省部级以上科技进步奖19项，发表SCI论文241篇，专利授权17项，现有省部级重点实验室3个，苏州市重点实验室5个，校级科研创新团队2个。