在学校建设高水平特色性研究型大学的征途上，电子科学技术研究院作为学校工作的重要组成部分，以学校“质”、“量”并举的内涵式发展理念为指引，坚持多学科汇聚融合，加强与各学院的合作；坚持与教学结合，打造有特色的人才培养模式；坚持面向产业，促进科技成果转化和地方经济发展，确立了研发并举、军民并重、高起点和持续提高等发展战略，以实现电子科学技术研究院在高起点上的跨越式发展。
自2003年成立以来，电科院的发展贯彻“从无到有，从有到实，从实到强”的发展思路，立足基本条件建设和项目任务争取，通过灵活的运行机制，创新管理、用人和财务制度，依托学校的品牌和资源优势，整合学校内外部资源，加强与科研院所的合作，承接大型综合项目，逐步发展壮大，已经快速走过了“从无到有”的艰苦历程，并已进入重要发展阶段。
2009年底，院领导根据电科院目前发展的状态和面临的形势和挑战，将建院伊始拟定的“从无到有，从有到实，从实到强”的 “三步走”发展思路调整为“从无到有，从有到实，从实到专，从专到强”的“四步走”发展步骤。具体如下：
“从无到有”，主要标志是平台建立，运行模式和机制逐步确立。
“从有到实”，主要建立健全研究院的各种规章制度，摸索研究院各种运行机制，探索在科研工作用人、用工方面的改革，建立以企业财务制度为主的财务管理体系，建立科学合理的分配制度，依托电子科技大学，开展项目研究，进行小批量多品种的生产，逐步扩大生产规模和科研规模，凝炼研究院的科研、生产方向，逐步培育研究院的核心竞争力，形成核心技术，在科研和生产中逐步形成自己的特色和优势。
“从实到专”，是电科院规模发展到具有中等研究所以上水平，科研生产经费在亿元以上，有明确的技术发展方向，有鲜明优势的技术领域，有国内知名的技术带头人，有稳定、具有一定规模的科研骨干队伍，建立有国内一流水准的技术、科研、生产大平台，有一定市场的拳头产品，有国内一流的大项目和大成果，在国内建立影响力。
“从专到强”，经过若干年积累，电科院具有核心竞争力，有拳头产品，有一定知名度，规模和效益达到一定水平，能够自主发展，主要目标是成为国内知名的研究机构。
我们的中长期发展目标是：在不太长的时间内，把电子科学技术研究院建设成电子科技大学具有相当规模的专职科研、生产单位，成为电子科技大学未来科研发展的主力军，建成创新研究、重大、重点、工程项目的研究基地之一，成为电子科技大学科技体制、机制创新的示范基地，成为国家在电子信息技术领域知名的骨干研究机构之一，成为电子科技大学学科汇聚的平台。逐步建立现代企业制度，通过技术创新和成果转化，在未来一段时间内，成为特色鲜明的具有现代企业制度的上市企业。