基础学院建院于1997年，由上海理工大学与原南汇区人民政府联合筹建，全部校舍由南汇区兴建，是原南汇区第一所高等学校。这一区校合作模式在全国高校中率先走出了一条通过吸纳社会资源实现超常规发展的新路。自1998年第一批本科学生入学至今，已办学13年，培养了3万余名大一学生。
基础学院的主要工作内容是：学生管理、教学管理和后勤协调。学院针对地处南汇、远离总校的特点，依靠总校和南汇区的大力支持，各专业学院的支撑，实现“育人、服务、管理”的办学宗旨。
基础学院的办学理念是：“ 一个中心、两个转变、三个服务”。即以本科教学为中心：使新同学从高中生较快地转变为适应大学素质教育的学生，使刚刚大学毕业的辅导员较快转变为学生思想政治工作的主力军；以育人为根本目标，通过服务学生、服务教师、服务教学，实现加强学生思想道德教育，稳定教学和生活秩序，努力提高教学质量。与此同时，逐步建设基础学院，实现基础学院持续发展。
基础学院位于浦东新区（原南汇区）惠南镇，占地总面积77300㎡（合116亩）、建筑面积27700㎡。
一、生活区
生活区有学生宿舍6个单元，共355间寝室，男240间，1698个床位，女115间，816个床位，可容纳2500名学生；一座食堂，上下两层、1000余个座位；室外400米标准跑道运动场1个，4个篮球场与三个排球场。
二、教学区
学院教学设施中有学术报告厅1个、多媒体教室34个、 一般教室14个，座位5286个；计算机房2个，教学用电子计算机375台；图书馆分馆藏书近5万册、订阅杂志279种、报纸90种；1个1100㎡室内体育馆，放置30只乒乓桌，羽毛球场地6个，并有有一可供文艺演出的舞台。
三、学生和专业
基础学院现有2011级新生2300余人。学生的教学与管理，采用跨校区多学科专业一年级大学生集中教学、管理与培养的模式。学生的学科大类有工学、经济学、管理学、等3大学科，涉及机械设计及其自动化、金融学、会计学、市场营销、电子商务、工程管理、国贸经济、电气工程及其自动化、自动化、电子信息科技、动力类专业、环境工程、建筑环境、交通工程、土木工程、等几十个专业类别，分属于上海理工大学下属的动能工程学院、管理学院、光计学院、机械工程学院、环境学院等5个二级学院。学生在基础学院学习的一个学年，需完成大部分基础课程和部分专业基础课的学习任务，第二学年转入各专业学院继续进行专业基础课和专业课的学习。
四、学院管理队伍
基础学院现有在编教职工18人，其中院党政领导干部3人、行政管理人员4人、政治辅导员12人。学院下设综合办公室、教学办公室和辅导员工作室，分别负责学院的行政、教学管理和学生管理工作。
辅导员队伍建设培养
结合基础学院跨校区办学模式和新时期辅导员队伍综合素质提高的特点，将学生思政工作、行政工作、教学与教学管理“四结合”（学生思政工作、行政工作、教育管理工作。教学科研教工作），努力建设培养一支素质高、有活力、肯吃苦、能战斗的思想政治辅导员队伍。
学生和学生干部队伍建设培养
以学生党建工作为抓手，积极开展大学生思想教育工作。开门办党校，开展众多的社团活动，使大学生真正成为校园文化建设主力军。利用校区周边地区的社会资源，积极组织大学生开展社会实践活动，已有文明共建单位镇人大、电信局、文化馆、图书馆、看守所、派出所、交警局、校办二厂等八家单位。基础学院办学多年来已形成了传承百年老校的优良传统的新基础学院精神：“勇于吃苦 团结协作 开拓创新 奋发有为”。学院连续三年获得学校精神文明“双十佳”奖励，其中连续四年获得校精神文明“十佳好人好事”荣誉。2009年更是获得“2007－2008年度校级文明标兵单位”称号殊荣。基础学院大一学生在学校体育文化建设中也是久负盛名、屡创佳绩的劲旅，全校合唱比赛一等奖，连续两年冬季长跑冠军。基础学院全体员工决心在校党委的领导下，以科学发展观为指导有决心，有信心，把学生培养教育工作做得更好，力争把学院办成一所校领导放心，学生高兴，家长称心，教工顺心的优秀学院。