厦门大学医学院位于“海上花园”城市厦门，现任院长为教育部“长江学者”特聘教授刘祖国博士，党委书记为邵鹏飞同志。1996年10月厦大医学院的成立使厦门大学拥有了更完整的学科体系，医学院秉承“自强不息，止于至善”的校训，依托高水平综合性、研究型大学的学科优势，通过整合办学资源，促进学科交叉，旨在培养医学基础雄厚、临床技能扎实、人文素养深、创新能力强的“德高艺精、仁心仁术”型高水平医学人才。
学院拥有厦门大学附属中山医院、厦门大学附属厦门眼科中心、厦门大学附属东南医院、厦门大学附属东方医院、厦门大学附属第一医院、厦门大学附属成功医院、厦门大学附属福州第二医院等7家三级甲等医院、20余家教学医院与实习基地;同时还正在积极建设一所高水平综合性的新附属医院——厦门大学附属翔安医院。
学院现有教职工560余人，硕博士生导师200余人，教授、副教授243人，其中双聘院士4人，教育部“长江学者”特聘教授1人，国家杰出青年科学基金获得者2人、福建省“闽江学者”3人。专任教师队伍中具有博士学位的人员占76.1%，实验技术队伍中具有博士学位人员占11.67%。
学院下设基础医学部、临床医学系、中医学系、眼视光系、护理系、福建省眼科与视觉科学重点实验室、福建省神经退行性疾病及衰老研究重点实验室、福建省慢性肝病研究重点实验室、福建省抗癌研究中心、福建省基础医学实验教学示范中心、福建省药学实验教学示范中心、海峡(厦门)中医药科技平台、厦门市手性药物重点实验室、厦门大学眼科研究所、厦门大学消化疾病研究所、厦门大学器官移植研究所、中心实验室和厦门大学医学院——加州心脏核磁共振临床教学与培训基地等41个教学科研机构。其中国家级临床重点专科4个、省部级科技平台6个、中国人民解放军全军专科中心9个、市校级科研平台37个。
学院现有本科专业3个(临床医学、中医学、护理学)、一级学科硕士点3个(临床医学、基础医学、中医学)、博士点1个(生理学)和国家人事部博士后科研工作站3个，学院从2011年开始招收“本、硕、博一体化”拔尖创新人才班(大医班)。目前在校生4000余人，其中硕、博士研究生500余人、本科生近1500人、留学生近200人、在籍海外函授生2200余人。
近年来，获得国家“863计划”、“973计划”课题及省部级重大科研项目60余项;科研成果获奖总数300余项，其中国家科技进步二等奖2项、省部级各类科研奖项109项、中华医学二等奖1项，发表SCI收录论文400余篇;2012年获得国家自然科学基金51项(位列全校第1位)。
医学院与多个国家和地区的高等院校和科研机构建立合作关系，联合开展医学前沿重大课题研究，并举办国内外以及海峡两岸重要学术研讨会议。同时与国外高等院校和机构签署了一系列合作办学和交换培养的协议和备忘录，已有临床医学、护理学等专业多批次同学赴瑞典、新加坡等国家和香港、台湾等地区交流学习。同时，还有来自世界各地的学生正在我院学习。
厦大医学院肩负医疗卫生事业的社会责任和历史使命，为50余个国家输送了近万名医学人才。厦门大学占地面积3645亩的医学及生命科学新校区的启用，使医学院跨越式发展的后发优势更加强劲。厦大医学院正站在新的起点，努力为厦大门学建设世界知名的高水平研究型大学打下更坚实的基础，为中国及世界培养更多合格的高水平医学人才!