厦门大学翔安校区位于厦门市翔安区新店镇，北依香山山脉、南临翔安南路、东接沙美村、西连茂林村，距思明校区34公里。校区占地面积3645亩，规划建筑面积115万平方米，现已投入使用60万平方米。校区主要建筑恢弘大气，延续思明校区“嘉庚建筑”风格，注重建筑与环境的和谐统一。
翔安校区主要用于发展：一是重点布局生命、医学、药学、海洋、环境、生态、新能源等新兴学科和应用学科;二是重点构筑一批新兴应用学科的国家级、省部级科技创新平台;三是重点建设中国孔子学院总部南方基地。医学院、药学院、公共卫生学院、生命科学学院、海洋与地球学院、环境与生态学院、国际学院以及能源研究院等8个学院已于2012年9月入驻。翔安校区将成为新兴应用学科高层次创新人才培养的重要基地，成为科技创新和产学研合作的重要基地，成为支撑全球孔子学院发展的重要基地。对于服务国家、福建和厦门市经济社会发展，促进经济发展方式转变，为发展战略性新兴产业提供科技和人才支撑具有重大意义。
学校在翔安校区设立党工委和管委会，下设办公室、学生办、教务办、保卫办、财务办、资产后勤办、基建办等常设机构，并在此基础上设立学生事务大厅、教职工事务大厅、心理咨询中心、校园一卡通中心、后勤服务中心等服务部门。
学校将按照“一次规划、分期建设”的原则，继续有计划、有步骤地推进校区基本建设，到2015年基本完成一期建设工程，到2021年建校百年之际，基本完成翔安校区建设任务。
厦门至厦门大学翔安校区行使路线
1、自备车辆直抵翔安校区行驶路线：
A沈海高速翔安(马巷)出口→翔安大道→翔安南路→厦门大学翔安校区;
B厦门岛仙岳路(环岛干道)→翔安隧道→翔安大道→翔安南路→厦门大学翔安校区。(部分主要路口有交通提示牌)
2、乘坐公交车：751路从厦门本路(思明校区)至厦大翔安校区
备注：厦大翔安校区早晚班发车时间：早班06:00 ～晚班21:30
厦门大学本部早晚班发车时间：早班06:40 ～晚班22:20
每间隔10—15分钟一班，每天运行143班