行政管理侧重为政府输送专门的管理人才，主要是指政府的管理。公共事业管理则注重为企事业单位培养为公众利益服务的专业人才，具体的分析请看下文。
如果把整个管理学比喻成一棵大树，公共管理就是树上的一条枝，而行政管理和公共事业管理则是公共管理这条枝上的两个分枝。行政管理侧重为政府输送专门的管理人才，主要是指政府的管理。公共事业管理则注重为企事业单位培养为公众利益服务的专业人才，主要对文教、体育、卫生、环保、社会保险、各种社会管理等公共事业的管理。
1.报考条件不同
行政管理专业硕士的报考对象是主要是应届本科毕业生，属于学术型硕士;公共事业管理专业硕士(MPA)的报考对象，限定为有4年或4年以上的实际工作经历的政府部门以及非政府公共机构的工作人员，所以应届生不能报考。此外，公共事业管理专业硕士要考数学，一般为数学四。而报考行政管理专业一般不考数学，个别学校特殊要求例外。
2.就业前景的不同
行政管理的毕业生不仅可以从事党政机关事业单位的行政部门，也可以在工商行政管理部门、涉外经济管理部门、经济监督检查等管理部门从事政策和法规研究及实际工作;公共事业管理专业毕业生的就业去向大致有两类：一是在公共部门从事行政和人事管理工作，另一类是在咨询公司，为政府部门、公司企业及其他公共部门从事管理咨询。
3.培养方式不同
①行政管理致力于培养系统掌握行政管理、政府监控、公共政策、城市管理基本理论和方法，能够熟练运用一门外语，具有独立思考、分析和解决问题的能力，能胜任各级党政机关、企事业单位、社会公共组织的实际工作，也可以在高等学校和科研院所从事教学与研究工作的高级人才。
②公共事业管理(MPA)针对应用性强的特点，在教学形式上采取课堂讲授、案例分析、模拟训练、参与式研讨和社会调查等多种形式。教学过程中注重理论联系实际，着力培养和训练MPA研究生认识问题、理解问题、分析和解决实际问题的能力，强调MPA研究生总揽全局、宏观决策、处理复杂问题、依法行政、专业化管理、逻辑理解等能力的训练。注重与政府部门相关部门及专业研究机构的联系、交流与合作。