日本留学医疗费非常贵。比如：没有加入保险的情况下，只是因为感冒去医院看病，一次也要花大约5000 日元，治疗一颗蛀牙需花数万日元，因为盲肠炎而住院一周的话，其费用近30-40 万日元，在经济上会成为很大的付担。为既能接受治疗，又没有经济上的不安，在日本居住的所有外国人也都要加入健康保险，这已为法律所规定。法律还规定在日本预定停留1 年以上的外国人也都要加入国民健康保险，加入手续在市、区、街、村政厅办理，每月缴保险费。保险费金额因地区而异，没有收入的外国留学生的保险费通常可以得到减额。
加入了国民健康保险，因受伤和疾病需要接受治疗的时候，如果在挂号窗口出示保险证，自己只付担适用保险诊疗部分医疗费的20%-30%，便可接受诊疗。但是保险诊疗适用的医疗费将全部由自己负担。
还有，在加入国民健康保险后，在向日本国际教育协会的外国人留学生医疗费补助提出登记，国民健康保险的保险诊治医疗费中个人付担金额的80% 还可以得到补助。登记手续向所在大学等的承办课办理。要注意保险诊治适用外的医疗费用不受补助。
因而将国民健康保险和外国人留学生医疗费补助制度结合起来的话，外国留学生的保险内诊治医疗费的个人付担金额仅是全部医疗费的4-6% 即可。另外，如接受外来诊治，开药方也要一定的负担，这时也可以享受到外国留学生的医疗费补助。