国立大学在日本都是一流大学，由政府出资兴办，与众多私立大学有本质区别。国立大学基于政府资金支持，攻读硕士的费用比欧美国家便宜很多，也比读语言学校便宜很多。日本国立大学都设有大学院(研究生院)，开设硕士、博士课程。日本国立大学大学院入学考试和面试只在日本国内举行，而且竞争激烈。由于签证、语言等原因，中国学生很难赴日参加考试。
就读日本国立大学大学院的学生持有留学签证，这在申请奖学金、享受医疗保险、就业、交通费折扣等方面拥有更多的机会和优惠。
赴日读研的基本优势如下：
1、日本教学质量尤其是大学教学质量世界一流。日本拥有世界一流大学且生活环境极好，培养了多名诺贝尔奖获得者。
2、日本经济发达，打工薪水高。同时又因为其劳动力严重短缺，于是成为了世界上最容易就业的国家之一。在就学期间，绝大部分学生可以实现学费、生活费自理，极大地减轻家庭负担。
3、日本国、公立大学在入国管理局和大使馆有很高的信誉，签证申请一般来说都比较顺利和简单，成功率颇高。
4、日本国立大学学费便宜。平均只有30-40万日元/年 (2.4万-3.2万人民币/年)，接近国内研究生学费，并且还有获得奖学金的机会。
5、直接申请日本大学院研究生，可以参考研究室的过去问题集，还能直接跟教授学习半年，在入学考试时会与很大的优势。国立大学一般都设有面向留学生的免费语言课程，省去就读语言学校的时间和金钱。
6、一流大学就业前景比较光明。赴日读硕士将来无论回国或留日，都会有良好的就业前景。如在日本就业，一年即可收回全部教育投资。
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日本接收外国留学生的方式有两种：一种是具有一定日语水平的人，可以经过各大学的选拔考试直接进入大学学习。另一种日语水平较差者，可先进入大学附属的日语学校或是民间的日本语专科学校，接受一年或一年半的日语准备教育，然后再经过全国统考进入大学学习。
基本条件
(1)已获得日本某高等学校的入学许可证;
(2)在日本有身份担保人;
(3)具备可靠的经济担保(申请人假如有相称于50万日元外币存款的可免);
(4)身体健康;(5)年龄在18-30岁之间。
日本使、领馆向前往日本学习的自费留学生签发的签证有两种：一种是4-1-16签证，一种是4-1-16-3签证。那么这两种签证有何区别呢?以下我们来了解一下。
4-1-6签证
对象为申读高等院校的自费留学生，这种学生在日本通常被称为正式留学生，获这种签证的居留期通常为1年、6个月或3个月。日本保证人将《入学通知书》和《在留资格认定书》(4-1、6)寄给申请人，由申请人持上述证件向公安机关申请护照。
申请人取得护照后，具备下列材料就可向日本大使馆申请留学签证。
(1)留学理由书。详细填写去日本学习的目的和选修的学科，一式两份。
(2)个人履历书。从小学填起，一式两份。
(3)誓约书。一式两份，式样内容由日本使馆提供，申请人照抄一遍后签名即可。
(4)填写日本入境签证申请表。一式两份。
(5)经公安机关出具的申请人与保证人关系的证明。
(6)申请人最后学校的毕业证书。(7)录取学校的入学通知书。
(8)身元保证书。须写明保证申请人在日学习期间的旅费、学费和生活费，并保证申请者遵守日本法律并按期返国。一式两份。
(9)保证人的纳税证明书。
(10)申请人的护照和免冠近照5张。
4-1-16-3签证
对象为就学生，即那些自费到日本留学，因语言纯熟程度不符合要求，不能直接升入各大学学习而先进入语言学校学习日语的外国学生(包括其他技艺学校的学生)，他们不是正式留学生。在日本，他们被称为就学生(或难留学生)，以区别正式留学生。获这种签证的就学生，在日居留期限，通常只签半年。在国际学生学院开设的语言学校学习的自费生，也可能获得4-1-6签证。
(1)申请人通过保证人向拟前往的日本语言学校申请入学许可证。
(2)由保证人持入学许可证，向入国管理局申请办理"就学事前审查"手续。
(3)入国管理局经审核，批准后就发给保证人一份"就学生入国事前审查终了证"，再由保证人寄给申请人。
(4)申请人持"就学生入国事前审查终了证"和其他手续向公安机关出入境管理部门申请办理出国护照。
(5)向日本驻华使领馆索取"入境签证申请表"、"亲属关系表"、"誓约书"。
(6)填好使、领馆提供的表格，并书写一份就学理由书、个人履历书。
(7)将以上证明材料一并寄给日本驻华大使馆或领事馆办理签证，很快就可得到签证。