日本留学签证办理流程目前几乎所有赴日留学人员申请签证均为委托在日代理人代理申请，申请人在获得某高等院校的入学许可后，其在日代理人为其申办“在留资格认定证明书”，下面是小编搜集整理的日本留学签证申请有哪些流程，欢迎阅读查看。
申请在留资格时，代理人需向该学校所在地区的地方入境管理局及该局支所审查课或第一审查课提交下列书面材料各一份：
1、在留资格认定证明申请书
2、外国申请人两张照片
3、护照的复印件
4、证明适合代理人资格的证件
5、入学许可书的复印件或其他准许申请人入学的证明材料
6、申请人履历表
7、最终学历毕业证明书
8、日本语学校的修业完了证明书及出席、成绩证明书
9、证明本人或本人以外有支付在日本停留期间一切费用的资料
10、申请人拟在日本学习的内容(科目、时间)的证明材料
11、其他入境管理局所要的证明材料
12、回邮信封(付430日元邮票)
代理申请后，若无问题，则于2~3星期内向代理人寄出“在留资格认定证明书”。该在留资格认定证明书的有效期限为6个月。代理人在收到“在留资格认定证明书”后应立即寄给申请人。申请人在收到材料后即可向日本驻华使馆申请留学签证。
申请签证时须递交材料如下：
1、在留资格认定证明书正本2、两份留学理由书(详细写明去日本学习的目的和学科)
3、本人经历书(写明从上小学迄今为止的情况)
4、誓约书(由日本驻华使馆发给，本人应签名或盖章)
5、日本入境签证申请表(由日本驻华使馆发给)
6、亲属关系表(由日本驻华使馆发给)
7、本人如在国内直接申请签证，上述所有材料须递交给日本使馆，日本使馆再将材料送回日本国内审查，通常需要较长时间，而且被拒签的可能性也比较大。因此，建议采取由在日本代理人代办的方法.
日本留学签证办理材料及费用
赴日留学人员在办理日本留学签证时，需要提供的材料为：
一、留学日本签证基本材料
1、护照;
2、日本留学资格认定书的原件及复印件;
3、留学生签证申请2份;
4、个人照片2张。
二、留学日本签证附加材料根据留学签证申请人的个人情况不同，日本签证部门还可能要求其提供以下一些材料。
1、留学生基本情高中生韩国留学况调查表
2、申请人配偶为日本公民的，需要提供结婚证的复印件;
3、在职员工进修时，需要提供自己的技能合同、研修合同书、进修协议等复印件，如以上材料有中文版，则也需提供复印件;
三、日本留学签证费用介绍目前使馆的签证签发手续费如下。但是，每年4月将根据汇率的变化进行调整。手续费请以现金支付。
一次有效签证：人民币200元;
多次有效签证：人民币400元。
日本留学签证拒签和再次申请
日本是教育资源比较丰富的国家，每年都有许多学子申请日本的各类学校。但并非每个人都能如愿以偿。
拒签理由细分有30项左右，大致归纳为三种：一、虚假材料，二、学习能力及意愿不足，三、违反入国管理局和难民认定法第七条第一项第二号标。
一、虚假材料。所谓虚假材料，简单的说就是申请材料不是真实的，比如毕业证作假，再比如成绩单作假。这种情况也是在各国申请留学中非常忌讳的。一旦被发现再申请很困难。但是入国管理局界定虚假材料不仅仅局限于此。一些不符合逻辑的履历也会被认为虚假。举个例子。曾经有个学生来找我，他曾被拒签过两次。原因是他小学是5年制的，后来又转学到3年制的高中，而且是5周岁上学。这导致他16岁就高中毕业。而正常情况下高中生应该是在18岁或19岁毕业的。入国管理局就认为他的履历不真实，导致拒签。这位同学非常执着，又用相同的材料再次申请，结果还是相同的原因被拒签。这种情况是要开具有力的相关证明来证明材料的真实性的。再次申请过程中要仔细分析拒签理由，增加文件辅助说明。缺乏逻辑的申请文件无论提交多少次，都会被拒签的。
二、语言能力与学习意愿。入国管理局要求学生在申请时就要有初级的语言能力，只要通过最基础的考试就能通过申请。再举个例子，曾经有名同学第一次申请是在一家小中介办理的，时间比较远，那时的申请学生需要提交一份日语试卷，中介为这位同学填写了试卷，卷面成绩满分，审核中期入管局电话调查，日语水平与卷面分数不符，结果也是拒签。建议大家在申请中提供自己的真实情况，过分的包装是要出问题的。语言这一关是要同学们通过自己的努力来过的，考试并不难，通过一至两个月的专业系统的培训，谁都能通过。只是有的同学学习方法不对或者是自觉性差些，自学考试有些困难，建议报名参加培训班，有个集体学习的环境后会事半功倍。
三、违反入国管理局和难民认定法第七条第一项第二号标准。这一条主要指的是经费支付的问题了。比如说开具收入证明这一项。要保证收入证明的真实性合理性。有的学生家长年薪30万。纳税额只有200块。这是明显不符合逻辑的。势必要被调查或拒签。或者提供假的存款证明，存折等。这种情况只要拨个电话就能鉴别真伪。因为篇幅原因不再赘述。每年都有一些DIY失败或者是不专业机构指导失误的案例。这种情况如果想推翻入国管理局的原判要准备大量充分的补充材料。所以第一次申请非常重要，日本留学申请不同于欧美国家。欧美国家最后与面签官见面，对申请材料有解释的机会。而日本是用材料换签，没有面见审核官的机会。所以申请材料决定一切。