番木瓜eIF4E和eIFiso4E的克隆及其与PRSV-VPg互作研究
论文摘要: 番木瓜环斑病毒(Papaya Ringspot Virus, PRSV)属于马铃薯Y病毒属(Potyvir(略)是制约番木瓜种植业和加工产业的主要因素.在马铃薯Y病毒基因组5’端(略)因组连接蛋白(virus genome-linked protein, VPg), VPg可在病毒的感染周期中干预几个步骤,包括病毒RNA的复制,病毒细胞间移动和长距离移动.真核翻译起始因子4E (eukaryotic translation initiation factor 4E, eIF4E)能够与mRNA的帽子结构或帽子同系物特异地交(略)白质合成的起始中起关键作用.通常情况下,mRNA是通过5’帽子结构与eIF4E结合,但马铃薯Y病毒属病毒基因组的5’端没有帽子结构,而是共价结合VPg蛋白.研究发现,病毒基因组连(略)与eIF4E的结合在多种马铃薯Y病毒属病毒侵染植物过程中起关键作用,通过突变eIF4E的关键位点能影响病毒-植物的互作,并能介导植物对病毒的抗性.eIF4E是一个多(略)植物中eIF4E家族成员包括eIF4E及其异构体eIFiso4E,这两个因子在翻译起始过程的作用...
The potyvirus papaya ringspot virus (PRSV) is an important pathogen that restricts papay(omitted)ion and cucurbits production. At the 5end of the potyvirus genome, there is a viral(omitted)inked to the genome (VPg) which m(omitted)ne at several steps in the virus infection cycle, including viral RNA replication, and viral cell-to-cell and long-distance movement.(omitted)otic translation initiation factor 4(omitted)n bind with m7GpppN cap structure of mRNA or cap homologue specifically play impor...
目录:摘要 第4-6页
Abstract 第6-7页
目录 第8-12页
1. 引言 第12-27页
·番木瓜环斑病毒概述 第13-16页
·症状表现 第13页
·PRSV株系、寄主范围和传播途径 第13-14页
·马铃薯Y病毒属基因组结构和功能研究 第14页
·番木瓜抗PRSV基因工程研究 第14-16页
·真核翻译起始因子4E的结构、功能和调节 第16-17页
·真核翻译起始因子4E的结构 第16页
·真核翻译起始因子4E的功能 第16页
·真核翻译起始因子4E的调节 第16-17页
·植物真核翻译起始因子4E的研究进展 第17-22页
·真核翻译起始因子4E与蛋白质翻译起始 第17-18页
·eIF4E参与马铃薯Y病毒繁殖的可能机制 第18-19页
·马铃薯Y病毒可选择性地利用eIF4E基因家族的成员 第19-20页
·植物eIF4E与病毒互作的研究 第20页
·eIF4E在植物抗病上的研究 第20-22页
·本文研究蛋白质相互作用的方法 第22-24页
·细胞核酵母双杂交 第22-23页
·双分子荧光互补技术 第23-24页
·本研究的目的意义和技术路线 第24-27页
·目的意义 第24-26页
·技术路线 第26-27页
2 材料与方法 第27-51页
·材料与试剂 第27-33页
·植物材料 第27页
·主要的酶和生化试剂 第27页
·菌株和质粒 第27-28页
·表达载体及克隆载体图 第28-30页
·培养基 第30-33页
·主要仪器设备 第33页
·番木瓜eIF4E和eIFiso4E基因的克隆 第33-39页
·番木瓜RNA提取 第33-34页
·试验器材的处理 第33-34页
·从组织中提取总RNA 第34页
·双链cDNA合成 第34-35页
·引物设计和RT-PCR反应 第35-36页
·PCR扩增程序 第36页
·PCR产物回收与鉴定 第36-39页
·PCR产物回收 第36-37页
·PCR回收产物与克隆载体pMD18-T Vector的连接 第37页
·大肠杆菌感受态细胞的制备(氯化钙法) 第37-38页
·连接产物转化感受态细胞 第38页
·重组质粒的菌液PCR鉴定 第38页
·序列鉴定与分析 第38-39页
·酵母双杂交鉴定PRSV-VPg与番木瓜eIF4E和eIFiso4E的互作 第39-47页
·酵母诱饵表达载体pBD-GAL4 Cam-VPg的构建及鉴定 第39-41页
·VPg基因加入相应的酶切位点 第39页
·重组质粒的提取(采用TIANGEN小提中量试剂盒) 第39-40页
·重组质粒的酶切鉴定 第40页
·诱饵载体pBD-GAL4 Cam的制备 第40页
·VPg基因与诱饵载体pBD-GALA-Cam的连接 第40-41页
·连接产物的转化及鉴定 第41页
·酵母激活域表达载体pAD-GAL4-2.1-eIF4E/eIFiso4E的构建及鉴定 第41-42页
·番木瓜eIF4E和eIFiso4E基因加入相应的酶切位点 第41-42页
·重组质粒的提取 第42页
·重组质粒的酶切鉴定 第42页
·激活域载体pAD-GAL4-2.1的制备 第42页
·番木瓜eIF4E和eIFiso4E基因与激活域载体pAD-GAL4-Cam的连接 第42页
·连接产物的转化及鉴定 第42页
·诱饵质粒的转化及毒性与自激活检测 第42-44页
·酵母菌株表型鉴定及酵母感受态细胞的制备 第43页
·酵母菌株表型鉴定 第43页
·酵母感受态细胞的制备 第43页
·分别转化重组子pBD-GAL4 Cam-VPg和空载体pBD-GAL4 Cam(对照)入酵母YRG-2感受态 第43-44页
·诱饵表达质粒的毒性检测 第44页
·诱饵质粒表达的融合蛋白自激活检测 第44页
·激活域载体转化酵母YRG-2及毒性与自激活检测 第44-45页
·酵母感受态细胞的制备 第44-45页
·分别转化重组子pAD-GAL4-2.1-eIF4E/eIFiso4E、空载体pAD-GAL4-2.1(阴性对照)及pGAL4(阳性对照)入酵母YRG-2感受态 第45页
·激活域表达质粒的毒性检测 第45页
·激活域表达质粒自激活检测 第45页
·酵母双杂交 第45-46页
·含有诱饵质粒的酵母感受态细胞的制备 第45页
·转化激活域重组子入含有诱饵质粒的酵母感受态细胞 第45-46页
·酵母克隆的初步鉴定 第46-47页
·β-半乳糖苷酶影印法筛选阳性克隆 第46页
·阳性酵母质粒的提取、回转大肠杆菌验证 第46-47页
·阳性克隆的测序 第47页
·双分子荧光互补技术验证鉴定PRSV-VPg与番木瓜eIF4E和eIFiso4E的互作 第47-51页
·BiFc载体的构建 第47-50页
·添加酶切位点 第47-48页
·酶切反应体系 第48-49页
·BiFc表达载体的构建与鉴定 第49-50页
·重组质粒的大量提取(利用TIANGEN的高纯度大提试剂盒) 第50页
·基因枪转化 第50-51页
·金粉的处理 第50页
·基因枪的子弹制备 第50-51页
·轰击 第51页
·洋葱表皮预处理 第51页
·荧光显微镜下观察 第51页
3 结果与分析 第51-64页
·番木瓜eIF4E和eIFiso4E基因的克隆 第51-56页
·番木瓜果实总RNA的提取 第51-52页
·番木瓜eIF4E基因全长序列的克隆 第52-53页
·番木瓜eIFiso4E基因全长序列的克隆 第53页
·Cp-eIF4E和Cp-eIFiso4E结构分析 第53-56页
·酵母双杂交互作结果 第56-60页
·酵母表达载体的构建 第56-58页
·酶切位点引入PRSV-VPg、Cp-eIF4E及Cp-eIFiso4E 第56-57页
·诱饵载体和激活域载体的构建和鉴定 第57-58页
·酵母菌株YRG-2表型鉴定 第58页
·诱饵载体转化酵母YRG-2毒性及自激活检测 第58页
·激活域载体转化酵母YRG-2毒性及自激活检测 第58-59页
·酵母双杂交筛选结果 第59-60页
·营养缺陷型筛选及LacZ活性筛选 第59-60页
·回转验证及测序 第60页
·双分子荧光互补技术验证PRSV-VPg与Cp-EIF4E和Cp-eIFiso4E的互作结果 第60-64页
·BiFc载体的构建与鉴定 第60-62页
·基因枪转化结果 第62-64页
4 讨论 第64-67页
·Cp-eIF4E和Cp-eIFiso4E上与mRNA帽子及4G作用的活性部位氨基酸与其它eIF4E和eIFiso4E的高度保守 第64页
·已知抗病位点在Cp-eIF4E和Cp-eIFiso4E上的定位 第64-65页
·马铃薯Y病毒VPg利用植物eIF4E及eIFiso4E的情况 第65页
·GAL4酵母双杂交系统和BIFC同时研究PRSV-VPg与CP-eIF4E和CP-eIFiso4E的互作情况 第65-66页
·以番木瓜eIF4E为靶点抗PRSV的可行性 第66-67页
5 主要结论及进一步研究建议 第67页
·主要结论 第67页
·进一步研究建议 第67页
参考文献 第67-75页
附录 第75-76页
致谢 第76页
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