微生物学科是我校生物科学与技术学院的一门新兴学科。微生物学科以微生物教研室教师为主，并有学院内及学校相关专业（食品专业及林产化工、森保）的一些老师加盟。学科现拥有学士、硕士授予权，可分别授予理学学士、理学硕士学位。建校五十多年来，特别是改革开放和生物科学与技术学院成立以来，先后为国家培养了一批具有学士和硕士学位的专业人才。
微生物学科是国家211工程首期重点资助的学科之一，同时也是全国林业行业唯一的国家理科生物学教学与科研人才培养基地的主要支撑学科，承担着微生物学，微生物学实验，病毒学，微生物生态学等理科基地班的主干课程教学任务，还承担食品微生物学，工业微生物学，环境工程微生物学等本科教学课程以及高级微生物学、微生物遗传学与分子生物学等研究生学位课程教学任务。
微生物学科具有一支年轻的师资队伍，教学效果深受师生好评，在科学研究以及科技成果转化方面已取得了一定的成绩，在资源微生物学、环境微生物学、微生物生态学、菌物学、食品微生物学以及微生物生物防治等方面开展基础和应用性研究。尤其是在微生物降解、制浆，相思树的遗传转化，果胶酶诱导的植物抗病性，菌物多样性，污水中微生物的检测等研究领域取得多项研究成果，获得国家发明专利多项；多次参加国际国内学术会议。在国内外相关学术期刊上发表研究论文80多篇，其中SCI、EI 收录文章近10篇。