动科学院的前身为创办于1958年的畜牧兽医系。动物科学学院设有：动物科学基础教研室、动物生产教研室、动物医学基础教研室、动物医学研究室、动物遗传育种与繁殖研究所、动物保健研究所、奶牛研究所、牧草研究室、动物科技研究所、科技服务中心、实验兽药厂、兽医院以及多个校内外科教基地。学院现有教职工63人，其中教授9人，副教授22人，有在校各类学生800多人。
学院始终坚持教学、科研、开发推广相结合，牢牢把握畜牧业迅速发展的历史机遇，积极探索学科建设和社会需要的办学途径，走出了一条产、学、研相结合的办学新路，取得了显著成果，在畜禽良种选育及繁殖饲养配套新技术、动物营养、草业工程、动物药物研究和开发、畜禽疾病与保健、鱼类疾病与保健等方面形成了自身的特色，近十多年来，承担国家攻关和省(部)级科研课题以及国家和省自然科学基金项目70余项，参加福建省农业区域经济开发协作项目多次。研究成果获国家和省部级科技进步奖17项，国家发明奖、联合国科技之星奖、省科技星火奖各1项。其中畜牧兽医实践教学基地的创建和发展获省教学优秀成果一等奖。主、参编及撰写专著、教材38部，发表论文500多篇。许多科研成果已先后转化为生产力，产生了显著的社会效益和经济效益。学院先后开辟了包括圣农集团、长富集团、大乘乳品有限公司、天香集团在内的一大批校外教学科研基地。兴办了科技开发企业，研究开发了畜禽及水产养殖的系列药品和添加剂，有力地促进了教学、科研的发展。
学院积极改善办学条件，优化育人环境。教学科研大楼面积2500平方米，配置了较为先进的教学科研仪器设备。建立了多媒体教室，并通过了2000年省级实验室验收。动物生产学科为福建省211工程建设重点学科。
学院现设有：动物遗传育种与繁殖、临床兽医学、基础兽医学等三个硕士点、农业推广(养殖方向)专业硕士;动物科学、动物医学等本科专业;畜牧兽医(高职)专科专业、函授、成人脱产班、自考大专班、研究生专业证书班以及短期培训班。学院已形成了多学科、多层次的动物科学高等教育体系，拥有一支较雄厚的师资队伍和教学管理队伍。