经济学系前身为1918年暨南大学开设的商科。20世纪三、四十年代，著名经济学家马寅初先生与《资本论》的译者王亚南先生先后在经济学系执教，为经济学系的教学与研究铺垫了深厚的底蕴。
1958年，暨南大学在广州重建时恢复设立经济学系，成为华南地区最早设立的经济类系科。复办以来，经济学系集中了各地优异人才，培养了数千名毕业生，任职于港澳台、海外及内地工业、商贸、房地产、金融企业、政府部门、经济管理等部门。许多已成为单位的业务骨干，并在各行各业担任重要领导职务，为国家的经济建设做出了重要贡献。
1980年，政治经济学专业就获得了中国第一批硕士学位授予权资格，为我校经济类学科的发展壮大奠定了坚实基础。经济学系曾拥有的会计学、国际经济、工业经济、贸易经济等教研室，其后都分别发展成为了经济学院和管理学院现在相应的专业和系所。