军事预防医学系(原称军事卫勤统计系)成立于1992年11月，1999年根据全军第十四次院校工作会议精神更为现名。全系设有卫生勤务学、卫生统计学、军队劳动与环境卫生学、军事营养与食品卫生学、放射医学、军事卫生毒理学、军事、体育等九个教研室，拥有3个博士学位授权学科分别为1981年批准的卫生统计学、1986年批准的防原医学和1993年批准的流行病学)，6个硕士学位授权学科(分别为卫生统计学、放射医学、流行病学、毒理学、劳动与环境卫生学和营养与食品卫生学)。卫生统计学、放射医学、流行病学于1996年开始招收从国外获得博士学位的优秀留学博士从事博士后研究工作，1998年国家人事部批准为公共卫生与预防医学博士后流动站。现有三总部1995年批准的全军“三重建设”重点建设学科1个(高技术武器损伤医学防护)，全军重点实验室2个(流行病学重点实验室、新概念武器损伤医学防护重点实验室);国家计委1997年批准的“211工程”建设重点学科2个(流行病学、卫生统计学);陕西省教委1999年批准的陕西省重点建设学科3个(流行病学、卫生统计学、新概念武器损伤医学防护);总后勤部1995年批准的全军卫勤训练基地1个。流行病学教研室1997年加入国际临床流行病学工作网(CEU)，是全军目前唯一的入网单位，全军流行病学重点实验室是全国同专业中唯一的部级重点实验室。流行病学教研室、卫生统计学教研室是全军专业委员会主任委员单位，劳动与环境卫生学、放射医学、毒理学是全军专业委员会副主任委员单位。
我系师资力量雄厚，整体学术水平较高。我国卫生统计学创始人之一郭祖超(一级教授)、全军著名军队卫生学专家侯悦(一级教授)、全军著名放射病理学专家郭鹞(一级教授)等一批著名专家教授为学科的发展和建设作出了突出贡献。现有博士导师8人，硕士导师14人，一级教授2人，三级教授2人。全系人员中博士研究生17名，硕士研究生24名，本科48名，其余22名。中青年教师中获“全国优秀教师”1人，“全军优秀教师”1人，“有突出贡献的中青年专家”1人，“国家教育部骨干教师”1人，“总后勤部科技银星”1人，“中国有突出贡献的博士学位获得者”1人，陕西省“有突出贡献专家”1人。高级职称占全系人员的30%,中级职称占全系人员的35%;正高职人员平均年龄55岁，副高职人员平均年龄41.3岁，中级职称人员平均年龄33.6岁;副高职人员中具有硕士以上学位者占73.3%，中级职称人员具有硕士以上学位者占52.6%。
在系党委的领导下，全系教职员工以军委新时期战略方针为指针，以培养适应高技术局部战争需要，适应我军现代化建设需要，适应现代医学模式需要的合格人才为出发点，突出军事医学课程结构的优化，突出军事医学教学内容的更新，大力培养高素质的军事医学人才，为军事斗争准备提供强有力的人才和智力支持。坚持把军事教育、体育锻炼以及学员的自学能力与创新能力的培养贯穿于五年教育的全过程，取得了良好的教学效果。近年先后获得军队级优秀教学成果一等奖、二等奖、三等奖各一项，校级优秀教学成果一等奖2项、二等和三等奖各1项。
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