东南大学硕士生培养年限一般为2—3年（根据各专业培养方案确定）。
按照国家政策，从2014年入学的研究生开始实行收费制度。学校将按照国家和江苏省的规定收取学费，学费标准另行公布。
同时学校向全国研究生招生计划内（有固定工资收入的除外）的全日制硕士生发放国家助学金；在修业年限内符合条件的研究生，可评选国家奖学金、学业奖学金和学校、院系为研究生设置的奖助学金。学校、院系和导师为研究生设置“助教”、“助管”和“助研”岗位（统称为“三助”岗位），承担“三助”岗位的研究生，可以获得相应的岗位津贴，奖助办法另行公布。
若2014招生年度国家出台新的研究生招生政策，东南大学将做相应调整，并及时在东南大学研究生招生网予以公布。