福建师范大学体育科学学院前身是1941年创办的福建省立师范专科学校体育与童子军科;建国以后先后更名为体育卫生学系、体育系;2001年6月建成体育科学学院。
学院现设体育教育系、社会体育系和大学体育部，并设继续教育中心、训练竞赛中心、科技开发中心、体育科学研究所和体育运动实验中心，有运动人体科学、体育人文社会学、田径、体操、球类Ⅰ、球类Ⅱ、武术游泳共7个教研室。
学院拥有体育教育训练学博士学位点和体育教育训练学、体育人文社会学两个硕士学位点，是国家体育与艺术师资培养培训基地，形成了博士、硕士、教育硕士、本科及继续教育相衔接的多层次办学格局。
学院师资力量雄厚，现有教授9人，副教授44人，讲师29人，助教16人，博士生和硕士生导师11人，国际级裁判3人，国家级裁判7人，21人在全国及省级体育专业学会、协会和科研团体中担任重要职务。